課程選修

發布人:高級管理員 發布日期:2007-08-29

課程名稱:分子模型方法在計算機輔助藥物設計中的應用

課程介紹:本課程是太阳集团1088vip(也可以是計算化學專業和生物化學專業)研究生一年級前沿選修課程,旨在掌握如何利用計算機技術和生物信息技術進行理性計算機輔助藥物設計。計算機輔助藥物設計是應用量子力學、分子動力學、構效關系等基礎理論研究藥物對生物大分子受體(核酸,蛋白質)等作用的藥效模型,從而達到藥物設計目的。随着人類基因組計劃的完成和蛋白組學的迅猛發展,以及大量與人類疾病相關基因的發現,藥物作用的靶标分子将急劇增加;同時,在計算機技術推動下,計算機輔助藥物設計在近年來取得了巨大的發展。太阳集团1088vip研究生很有必要了解和熟悉其基本技能,最新發展和應用實例。

 

本課程講授有關分子模型設計的有關理論、藥物定量結構活性關系研究、生物大分子和藥物分子相互作用的動力學模拟、量化計算、基于結構的設計方法、虛拟高通量藥物小分子篩選等等,使學生了解和熟悉應用計算機輔助手段在藥物設計中思路和方法。本課程講授幾種分子模型軟件(Chemoffice 8.0 Hyperchem 7.5, 初始分子模型設計;SYBYL 6.9.2Discovery Studio 1.7, 定量結構活性關系研究和虛拟高通量藥物小分子篩選;Gaussian 03,量化計算;AMBER 9.0, 分子動力學)的使用。

 

本課程以應用實例為主(60%),20%為理論學習,20%為學生上機實驗。

考試方式:50%為閉卷考試,40%為案例分析,10%為上課考勤。

學時:60   學分:3分

授課教師:羅海彬博士(副教授)

 

本選項修課程主要面向07級研究生同學,有需要選修的同學請于九月十日前報送院辦307或打電話87334675,鄧鴻老師。