太阳集团1088vip羅海彬/李哲團隊受邀在國家科學評論(NSR)期刊發表高性能計算 在藥物設計領域的研究展望綜述
發布人：汪夕芳
發布日期：2021-06-21
近十年來，高性能計算（High performance computing, HPC）不斷發展，被稱為計算機第一定律的摩爾定律當前仍然有效，計算機輔助藥物設計方法也随之快速發展。HPC在藥物設計領域發揮着重要作用，可被用于如藥物-靶标結合強度預測（藥效預測）、虛拟篩選、分子動力學模拟和蛋白質折疊等，這些應用顯著加速了藥物發現的進程。在藥物發現過程中，如何快速準确地預測配體和成藥靶标之間的親和力、進而發現高效價的藥物，被認為是藥物設計中最核心問題之一。基于此，太阳集团1088vip羅海彬/李哲團隊受邀在國家科學評論(NSR)期刊發表了有關高性能計算在藥物設計領域的研究展望，文中着重介紹了能夠短時間内篩選數十億化合物的藥效快速預測方法，以及目前正在快速發展的基于更加嚴格的統計力學理論的藥效精準預測方法等。此外，文章還介紹了現階段基于HPC藥物設計方法的多種代表性應用，如HPC在抗新冠藥物發現中的應用（以采用基于自由能微擾藥效精準預測方法獲得了新冠應急藥物雙嘧達莫為例）。随着HPC計算能力的進一步提升及人工智能技術的發展，能夠預見到在不遠的将來，更多全新的藥物設計技術将會随之出現，基于HPC的藥物設計也将會對新藥研發産生更大的影響和推動作用。
文章于2021年6月18日在線發表于國家科學評論（National Science Review, NSR），該期刊最新影響因子為16.693，在綜合性期刊中排名第三位。太阳集团1088vip李哲副教授和李輝博士生為論文并列第一作者，羅海彬教授和上海藥物所于坤千研究員為論文的并列通訊作者。本研究受到國家重點研發計劃高性能計算專項、國家自然科學基金面上項目和青年基金等項目的經費支持。
圖1. HPC在藥物設計中的代表性應用